More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0061 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
356 aa  730  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
356 aa  730  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  60.91 
 
 
354 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  56 
 
 
349 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  52.32 
 
 
326 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.7 
 
 
327 aa  355  8e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  55.17 
 
 
325 aa  351  9e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  46.91 
 
 
344 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.2 
 
 
324 aa  164  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  31.78 
 
 
322 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.03 
 
 
337 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.71 
 
 
342 aa  141  1e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  30.84 
 
 
336 aa  134  2e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  28.17 
 
 
327 aa  132  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  31.64 
 
 
339 aa  121  1e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  27.1 
 
 
362 aa  113  4e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.17 
 
 
371 aa  109  7e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  26.74 
 
 
316 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.71 
 
 
325 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.96 
 
 
386 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.33 
 
 
367 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  25.32 
 
 
304 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.71 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.06 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.05 
 
 
357 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  27.64 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  25.38 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.91 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.21 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  25.07 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  27.09 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  26.28 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  26.28 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  27.55 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  27.55 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.55 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.91 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.81 
 
 
347 aa  89.7  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.96 
 
 
368 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.3 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.75 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  26.43 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  26.63 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.58 
 
 
372 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.16 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0557  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.58 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.91 
 
 
369 aa  85.5  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.59 
 
 
354 aa  85.5  1e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.39994e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.61 
 
 
325 aa  85.5  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  24.55 
 
 
360 aa  84.7  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  26.22 
 
 
265 aa  83.6  5e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  24.37 
 
 
364 aa  83.6  5e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.91 
 
 
372 aa  83.2  7e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  26.56 
 
 
376 aa  82  1e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.16 
 
 
318 aa  82  1e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26 
 
 
371 aa  82.4  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
815 aa  81.6  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  24.06 
 
 
1003 aa  81.6  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
817 aa  81.6  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  27.84 
 
 
396 aa  80.9  3e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.24 
 
 
362 aa  80.5  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  25.24 
 
 
364 aa  80.1  5e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  25.27 
 
 
328 aa  80.1  6e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  25.99 
 
 
371 aa  80.1  6e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.78 
 
 
365 aa  79.3  8e-14  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.55 
 
 
360 aa  79.3  9e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  26.58 
 
 
321 aa  78.6  1e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.16 
 
 
364 aa  79.3  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  25.52 
 
 
328 aa  79  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3948  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.71 
 
 
321 aa  79  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.828839  normal  0.672374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  23.17 
 
 
370 aa  79  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.24 
 
 
360 aa  78.2  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.62 
 
 
369 aa  78.2  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.43 
 
 
1003 aa  77.4  3e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.15 
 
 
1003 aa  77.8  3e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.86 
 
 
1003 aa  77.8  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
799 aa  77.8  3e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.79 
 
 
366 aa  77.4  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
815 aa  77  4e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.47 
 
 
374 aa  77.4  4e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.77 
 
 
1003 aa  77.4  4e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.71 
 
 
430 aa  77.4  4e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.77 
 
 
1003 aa  77.4  4e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.82 
 
 
385 aa  77  4e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.24 
 
 
360 aa  77.4  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0861  hypothetical protein  23.97 
 
 
318 aa  76.6  5e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.15 
 
 
1003 aa  76.6  6e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.7 
 
 
999 aa  76.6  6e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  27.08 
 
 
389 aa  76.3  7e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  26.46 
 
 
351 aa  75.9  9e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  27.5 
 
 
363 aa  75.9  9e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.16 
 
 
364 aa  75.5  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.32 
 
 
366 aa  75.5  1e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  26.25 
 
 
335 aa  75.9  1e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.97 
 
 
370 aa  75.5  1e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.14 
 
 
360 aa  75.9  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  22.36 
 
 
372 aa  75.9  1e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  27.5 
 
 
313 aa  75.5  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>