106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0054 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1230  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  89.77 
 
 
352 aa  655  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  6.83761e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0218  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  91.19 
 
 
352 aa  669  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00749598  normal  0.140739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2974  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  92.9 
 
 
352 aa  681  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0579  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  92.9 
 
 
352 aa  681  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3778  photosystem II D2 protein  89.77 
 
 
351 aa  645  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.6634e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1992  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  90.62 
 
 
351 aa  660  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0481037  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2375  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  90.62 
 
 
351 aa  660  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.116163  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1637  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  92.61 
 
 
352 aa  677  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.719245  normal  0.411385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1960  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  100 
 
 
352 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0655  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  92.61 
 
 
352 aa  677  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0056  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  100 
 
 
352 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0317  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  90.34 
 
 
351 aa  660  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5031  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  91.19 
 
 
352 aa  669  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1059  photosystem II D2 protein  89.77 
 
 
351 aa  645  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00303262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1987  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  100 
 
 
352 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  3.47488e-06  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2512  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  92.61 
 
 
351 aa  667  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.39889e-12  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0054  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  100 
 
 
352 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  3.10792e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0668  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  90.34 
 
 
370 aa  659  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1242  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  92.61 
 
 
351 aa  667  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08431  photosystem II PsbD protein (D2)  84.94 
 
 
361 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13491  photosystem II PsbD protein (D2)  82.73 
 
 
358 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13341  photosystem II PsbD protein (D2)  82.73 
 
 
358 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13241  photosystem II PsbD protein (D2)  82.73 
 
 
358 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1256  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  82.73 
 
 
358 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.525439  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0767  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  81.89 
 
 
358 aa  606  1e-172  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16071  photosystem II PsbD protein (D2)  81.89 
 
 
358 aa  606  1e-172  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0432746  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12331  photosystem II PsbD protein (D2)  81.34 
 
 
358 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.153207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02461  photosystem II PsbA protein (D1)  32.48 
 
 
360 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12521  hypothetical protein  32.24 
 
 
360 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02441  photosystem II PsbA protein (D1)  32.24 
 
 
360 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.729491  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02451  photosystem II PsbA protein (D1)  32.24 
 
 
360 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0225  photosystem q(b) protein  32.24 
 
 
360 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1144  photosystem q(b) protein  32.24 
 
 
360 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02531  photosystem II PsbA protein (D1)  32.24 
 
 
360 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02551  hypothetical protein  32.24 
 
 
360 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1042  photosystem q(b) protein  33.01 
 
 
358 aa  164  2e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1389  photosystem q(b) protein  31.73 
 
 
360 aa  163  5e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  1.63699e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0893  photosystem q(b) protein  31.73 
 
 
360 aa  163  5e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.40892e-10  decreased coverage  0.000169599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0735  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1592  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0558  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03031  hypothetical protein  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235365  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13251  hypothetical protein  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.561783  normal  0.197158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15721  hypothetical protein  32.24 
 
 
360 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.131507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0830  photosystem q(b) protein  32.03 
 
 
360 aa  162  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00028698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0943  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.46 
 
 
358 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1652  photosystem q(b) protein  32.78 
 
 
360 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.390921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0182  photosystem q(b) protein  31.8 
 
 
353 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  8.57268e-05  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1059  photosystem q(b) protein  32.03 
 
 
360 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4763  photosystem q(b) protein  33.22 
 
 
353 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0183  photosystem q(b) protein  31.8 
 
 
353 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  9.80824e-06  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0424  photosystem q(b) protein  31.29 
 
 
360 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1498  photosystem q(b) protein  31.48 
 
 
360 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  2.98258e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2987  photosystem q(b) protein  31.97 
 
 
360 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2138  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  32.86 
 
 
360 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1597  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.48 
 
 
360 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.96706e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0169  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0452427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1049  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2293  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2460  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.48 
 
 
360 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3553  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.48 
 
 
360 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2904  photosystem q(b) protein  32.41 
 
 
354 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3216  photosystem q(b) protein  32.41 
 
 
354 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1237  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2016  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1267  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  3.99793e-06  hitchhiker  0.00458282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2041  photosystem q(b) protein  32.86 
 
 
356 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.21141e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04091  photosystem II PsbA protein (D1)  31.97 
 
 
358 aa  153  3e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1583  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  35.38 
 
 
360 aa  153  3e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.69219e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18681  hypothetical protein  31.97 
 
 
358 aa  153  3e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1706  photosystem q(b) protein  32.32 
 
 
362 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13247e-10 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3850  photosystem q(b) protein  29.26 
 
 
356 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3899  photosystem q(b) protein  28.98 
 
 
356 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0661393  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4121  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  30.54 
 
 
356 aa  148  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2036  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.15 
 
 
359 aa  140  4e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1814  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.15 
 
 
359 aa  140  4e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1817  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  31.15 
 
 
359 aa  140  4e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0307  photosystem q(b) protein  31.15 
 
 
359 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0519  photosystem q(b) protein  31.15 
 
 
359 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1564  photosystem q(b) protein  29.28 
 
 
356 aa  130  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.27544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1640  photosynthetic reaction center subunit M  24.43 
 
 
304 aa  58.2  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3994  photosynthetic reaction center subunit M  28.34 
 
 
307 aa  57  5e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0754193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1717  photosynthetic reaction center subunit M  27.72 
 
 
307 aa  54.7  3e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1604  photosynthetic reaction center subunit M  24.6 
 
 
323 aa  53.9  4e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.16429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3754  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  23.7 
 
 
641 aa  53.5  5e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0347506  hitchhiker  0.005487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3749  photosynthetic reaction center subunit M  27.81 
 
 
307 aa  51.6  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.201417  hitchhiker  0.0015702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3268  bifunctional photosynthetic reaction center subunit L/M  23.22 
 
 
643 aa  50.4  5e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0578169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2974  photosynthetic reaction center subunit M  27.48 
 
 
306 aa  49.7  7e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6430  photosynthetic reaction center subunit M  26.98 
 
 
308 aa  49.3  9e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864095  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3523  photosynthetic reaction center subunit L  22.94 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382012  normal  0.348787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3524  photosynthetic reaction center subunit M  25.45 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157228  normal  0.60913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1300  photosynthetic reaction center subunit M  27.27 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3995  photosynthetic reaction center subunit L  25.18 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.118346  normal  0.0163614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3750  photosynthetic reaction center subunit L  22.83 
 
 
277 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279579  hitchhiker  0.00154675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1716  photosynthetic reaction center subunit L  23.37 
 
 
277 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2975  photosynthetic reaction center subunit L  23.12 
 
 
276 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1639  photosynthetic reaction center subunit L  24.62 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1605  photosynthetic reaction center subunit L  22.53 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2058  photosynthetic reaction center subunit L  23.63 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3703  photosynthetic reaction center subunit L  25.52 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0461593  hitchhiker  0.00115696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>