More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0030 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
112 aa  231  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  100 
 
 
112 aa  231  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  54.55 
 
 
128 aa  132  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  54.46 
 
 
114 aa  130  7e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  54.37 
 
 
129 aa  124  4e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0149  thioredoxin domain-containing protein  50.94 
 
 
128 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.55638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  44.55 
 
 
115 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  44.55 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.34 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  37.37 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.58 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  42 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.37 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  35.29 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  34.31 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.17 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  37.35 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  37.35 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.89 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  37.35 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  33.93 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  40.96 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  31.37 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  43.04 
 
 
107 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  43.04 
 
 
107 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.21 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  40.96 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.29 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  45.57 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.98 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.45063e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.24 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.35 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.17 
 
 
106 aa  83.2  1e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  36 
 
 
108 aa  83.2  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  39.29 
 
 
150 aa  82.8  1e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  41.77 
 
 
109 aa  82.8  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  33.66 
 
 
112 aa  82  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  33.66 
 
 
107 aa  82  2e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  82  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  82  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  32.32 
 
 
106 aa  82.8  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  35 
 
 
107 aa  82.8  2e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  2.65159e-07 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  39.53 
 
 
109 aa  82.4  2e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  41.18 
 
 
110 aa  82.4  2e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  43.04 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.24 
 
 
107 aa  82  2e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  81.6  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  45.12 
 
 
165 aa  82  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.89 
 
 
105 aa  81.6  3e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  36.47 
 
 
106 aa  82  3e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.93 
 
 
109 aa  81.6  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  38.55 
 
 
108 aa  81.6  4e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  80.9  5e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.24 
 
 
119 aa  80.9  5e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  40.96 
 
 
106 aa  80.9  5e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  38.82 
 
 
106 aa  81.3  5e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  40.48 
 
 
106 aa  80.9  5e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  38.37 
 
 
110 aa  80.9  5e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  80.9  6e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  39.53 
 
 
259 aa  80.9  6e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.66 
 
 
108 aa  80.5  7e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  80.5  7e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  34.34 
 
 
108 aa  80.5  7e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  33.66 
 
 
110 aa  80.5  7e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  35.29 
 
 
105 aa  80.1  8e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  35.35 
 
 
112 aa  80.1  8e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  34.41 
 
 
107 aa  80.5  8e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  43.21 
 
 
108 aa  80.5  8e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  36.08 
 
 
108 aa  80.1  8e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  80.1  9e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  33.66 
 
 
107 aa  80.1  9e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  33.66 
 
 
107 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  79.7  1e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  79.7  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  35.64 
 
 
107 aa  79.7  1e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79.3  1e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.55412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  45 
 
 
113 aa  79.7  1e-14  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.66 
 
 
107 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  37.23 
 
 
107 aa  79.7  1e-14  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  33.68 
 
 
107 aa  79.7  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  79.3  1e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  35 
 
 
110 aa  80.1  1e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  36.05 
 
 
109 aa  79.7  1e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  32.35 
 
 
112 aa  80.1  1e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.31 
 
 
120 aa  79  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  79  2e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  41.25 
 
 
108 aa  79  2e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  79  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  38.1 
 
 
106 aa  79  2e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  79  2e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>