53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0003 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  68.07 
 
 
245 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  61.69 
 
 
279 aa  322  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  56.85 
 
 
248 aa  269  3e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  53.69 
 
 
257 aa  253  2e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  53.69 
 
 
257 aa  253  2e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  53.69 
 
 
257 aa  253  2e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  53.19 
 
 
262 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  47.35 
 
 
252 aa  248  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  51.48 
 
 
244 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  52.3 
 
 
244 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  53.16 
 
 
252 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  52.17 
 
 
266 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  52.72 
 
 
242 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  26.32 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  30.49 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  31.93 
 
 
203 aa  72.4  7e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  31.63 
 
 
193 aa  70.9  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  27.92 
 
 
215 aa  67.4  2e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.56 
 
 
197 aa  65.1  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  26.53 
 
 
213 aa  61.6  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.36 
 
 
205 aa  61.6  1e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  59.3  6e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  28.21 
 
 
196 aa  58.2  1e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  28.37 
 
 
223 aa  55.8  6e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  54.7  1e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.66 
 
 
220 aa  50.8  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  39.19 
 
 
207 aa  49.7  5e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  39.47 
 
 
165 aa  49.7  5e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.86 
 
 
198 aa  49.3  6e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
220 aa  49.3  6e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 
191 aa  48.9  7e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.03 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.76448e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.38 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.24 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  35.9 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 
189 aa  45.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  34.72 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  35.53 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  34.21 
 
 
168 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  32.46 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.94 
 
 
166 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  27.23 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  36.9 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.25 
 
 
214 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 
194 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.86 
 
 
209 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>