203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0033 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.00673e-14  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309195  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  91.43 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  90.16 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  90.16 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  87.88 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 
84 bp  61.9  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  61.9  2e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  61.9  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  61.9  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  61.9  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  7e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  2.86409e-07  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  7e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  56  1e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  56  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  56  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0026  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  1e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0038  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  54  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  5e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  5e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  5e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0029  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  54  5e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  5e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  2e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  5.71794e-06  hitchhiker  5.31069e-05 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.63342e-06  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0093  tRNA-Pro  90.48 
 
 
77 bp  52  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60330  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.39149e-07  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0008  tRNA-Pro  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  96.43 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0009  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408974  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0009  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  96.43 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4592  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>