More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5199 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  45.92 
 
 
229 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  42.22 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  42.22 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  44.08 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  38.1 
 
 
255 aa  178  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.24 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  33.05 
 
 
226 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.32 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.24 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  35.39 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.81 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.09 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.28 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.12 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  38.25 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.81 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.32 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.81 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.07 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  32.09 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  32.7 
 
 
237 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.05 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.55 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.58 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  37.28 
 
 
233 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.36 
 
 
204 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  32.75 
 
 
232 aa  85.9  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  30 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
217 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  26.6 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.69 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  36.91 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.65 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  35.44 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  32.7 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  28.4 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  34.03 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  36.76 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.3 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  37.74 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.4 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  37.74 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  37.74 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.15 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  32.38 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.19 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  28.18 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  30.65 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  29.22 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  32.77 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.85 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.9 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  29.88 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  31.51 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  37.22 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  30.51 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.22 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  37.93 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  30.4 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.76 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  29.58 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 
220 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.8 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  33.12 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  42.61 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  42.61 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  32.14 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.95 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  41.94 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.44 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  30.18 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  42.61 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.71 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  35.85 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>