More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5105 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
349 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  57.62 
 
 
364 aa  359  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  61.93 
 
 
356 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  62.46 
 
 
336 aa  346  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.78 
 
 
335 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.78 
 
 
340 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.92 
 
 
340 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  50.67 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  53 
 
 
300 aa  248  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  48.17 
 
 
316 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  48.17 
 
 
316 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  51.18 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  45.45 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  45.51 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  48.48 
 
 
319 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  43.85 
 
 
313 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  43.09 
 
 
313 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  43.89 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.62 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  30.71 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  30.61 
 
 
297 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  31.34 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.37 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.63 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  27.68 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.76 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.05 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.99 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  25.18 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  28.37 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.48 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.48 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.6 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  24.14 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.59 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  27.03 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  28.62 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.62 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.28 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.72 
 
 
296 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  24.31 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  28.8 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.94 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.61 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.14 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  26.45 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  30.14 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  29.81 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  26.01 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.69 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  27.7 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.53 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  24.21 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.09 
 
 
306 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.53 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.53 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.91 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.53 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.53 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  26.09 
 
 
292 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24.67 
 
 
319 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.36 
 
 
294 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  24.3 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  27.08 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  28.62 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  25.25 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  24.26 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  23.26 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  23.26 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  25.75 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.91 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  25.75 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  25.75 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  23.26 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.94 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  25.75 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  25.25 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>