More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5038 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  100 
 
 
358 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  46.18 
 
 
478 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  47.62 
 
 
473 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  46.91 
 
 
495 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  46.91 
 
 
495 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  45.99 
 
 
495 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  43.2 
 
 
492 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  41.56 
 
 
551 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  33.97 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  34.42 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  31.29 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
508 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  31.54 
 
 
580 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  22.65 
 
 
415 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  32.17 
 
 
478 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.21 
 
 
803 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.75 
 
 
781 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  22.58 
 
 
417 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  30.15 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
948 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.31 
 
 
920 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.04 
 
 
1055 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  29.39 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.96 
 
 
834 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.22 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  31 
 
 
753 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30 
 
 
576 aa  93.2  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.45 
 
 
920 aa  93.2  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.95 
 
 
915 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.91 
 
 
919 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
922 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.08 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  26.35 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.92 
 
 
910 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 
921 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.9 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  29.8 
 
 
577 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  28.44 
 
 
919 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  28 
 
 
827 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
931 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  26.21 
 
 
936 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
828 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  24.59 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.24 
 
 
317 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  26.71 
 
 
277 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.73 
 
 
912 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
828 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
205 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.51 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  26.13 
 
 
833 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.96 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  29.2 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.2 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  27.08 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.36 
 
 
869 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.53 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.1 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  25.84 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.69 
 
 
869 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.52 
 
 
264 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.18 
 
 
833 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.35 
 
 
830 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  27.33 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  45.26 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.16 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  26.4 
 
 
952 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.81 
 
 
852 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  31.18 
 
 
849 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.22 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
940 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.37 
 
 
869 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.01 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  28.79 
 
 
700 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.36 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  30.38 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.73 
 
 
977 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.01 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  34.13 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  26.95 
 
 
846 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
823 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.19 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  30 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.97 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
830 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.97 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.97 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  25.64 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  30 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.04 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.67 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.27 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.21 
 
 
812 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.27 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.27 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  27.09 
 
 
700 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>