More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4804 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  67.68 
 
 
99 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  66.67 
 
 
104 aa  146  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
99 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  67.33 
 
 
104 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  69.39 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  61.39 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  61.39 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  60.2 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  59.18 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  59.18 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  57.89 
 
 
99 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  56.12 
 
 
99 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  56.84 
 
 
100 aa  120  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 
99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  56.84 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  54.08 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  54.08 
 
 
99 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 
99 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  54.08 
 
 
99 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  67.11 
 
 
123 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  53.06 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
94 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  47.42 
 
 
102 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  68.06 
 
 
103 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  52.04 
 
 
111 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 
96 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  47.96 
 
 
106 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  46.94 
 
 
99 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  46.94 
 
 
99 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  53.85 
 
 
94 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  51.02 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  47.47 
 
 
268 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  40.82 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  53.16 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  52.63 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  40.82 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  40.82 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  41.49 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  40 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  45.57 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.04 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.04 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  41.94 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.03 
 
 
358 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  36.46 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  37.18 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  36.17 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  41.67 
 
 
361 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  44.3 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  38.3 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.45 
 
 
362 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.31 
 
 
364 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  34.74 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.1 
 
 
358 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.08 
 
 
362 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.44 
 
 
329 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.44 
 
 
329 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.44 
 
 
329 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  36.17 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  39.44 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  35.63 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.44 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  40.24 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  37.84 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  40.74 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  34.74 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.88 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  46.48 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  35.62 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  45.71 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  38.89 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  43.84 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.72 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  37.5 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  40.26 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.72 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.5 
 
 
365 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.72 
 
 
358 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.06 
 
 
362 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.67 
 
 
344 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.65 
 
 
352 aa  63.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.06 
 
 
669 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>