17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4788 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4788  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.175046  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3007  hypothetical protein  65.38 
 
 
134 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117805  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1972  hypothetical protein  68.18 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0054  hypothetical protein  71.19 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  44.44 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  44.12 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  60.38 
 
 
566 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4551  hypothetical protein  55.77 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  44.07 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  44.07 
 
 
191 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.71 
 
 
554 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  46.94 
 
 
561 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.33 
 
 
570 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  37.35 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  43.75 
 
 
551 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
553 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.21 
 
 
559 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>