More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4723 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
378 aa  743    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.87 
 
 
355 aa  554  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.73 
 
 
376 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.75 
 
 
371 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.75 
 
 
371 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  71.77 
 
 
372 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  68.78 
 
 
371 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  67.54 
 
 
351 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
364 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
360 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
367 aa  269  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
367 aa  268  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
363 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
558 aa  259  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.74 
 
 
379 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.41 
 
 
394 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
387 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
516 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
390 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.47 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
387 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
386 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
380 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
386 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.11 
 
 
387 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
426 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1706  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
378 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
391 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
532 aa  230  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
368 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
368 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135755  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
373 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
376 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0112138  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.73 
 
 
384 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.61 
 
 
516 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.75 
 
 
387 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
376 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.899475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
375 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
495 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
396 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
496 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
485 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.98 
 
 
542 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000497228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 
497 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
377 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.765762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
283 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
494 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 
283 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
379 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  46.02 
 
 
283 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.81 
 
 
479 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.25 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.25 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
285 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647572 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5117  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.5 
 
 
373 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  44 
 
 
288 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  32.99 
 
 
473 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
317 aa  195  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
468 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
658 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.22 
 
 
284 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
316 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
285 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.25 
 
 
307 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
282 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
392 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
300 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
293 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0854715  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
293 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.25 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  44.25 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
462 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211529  hitchhiker  0.00061128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
299 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
307 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
296 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  43.81 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.81 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
280 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  42.48 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.33 
 
 
317 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.15 
 
 
302 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
603 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
280 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>