More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4680 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36.15 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  37.3 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  40.34 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 192 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.07 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.86 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.34 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.07 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 540 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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