More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4642 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  75.09 
 
 
312 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  68.09 
 
 
329 aa  427  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  68.58 
 
 
306 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.34 
 
 
316 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  65.69 
 
 
318 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  65.36 
 
 
318 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.37 
 
 
313 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.53 
 
 
333 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  55.56 
 
 
339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  57.86 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  55.22 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  55.22 
 
 
326 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.86 
 
 
320 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.7 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0195  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.36 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0799995  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.36 
 
 
319 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  51.46 
 
 
306 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  51.36 
 
 
323 aa  295  6e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  49.83 
 
 
305 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  53.92 
 
 
327 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  51.88 
 
 
304 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  52.05 
 
 
304 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.92 
 
 
303 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  47.77 
 
 
304 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  50.68 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  47.37 
 
 
377 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  53.49 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  52.07 
 
 
309 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  48 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  51.38 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  48.38 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2308  pseudouridine synthase, RluA family  51.89 
 
 
342 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.85 
 
 
347 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.21 
 
 
303 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.85 
 
 
334 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  48.12 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  47.84 
 
 
303 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50 
 
 
296 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  46.93 
 
 
334 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  53.24 
 
 
334 aa  278  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  48.04 
 
 
391 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  47.44 
 
 
302 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  47.44 
 
 
302 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  47.1 
 
 
302 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  47.1 
 
 
302 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  47.1 
 
 
302 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.1 
 
 
302 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  47.1 
 
 
302 aa  275  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.1 
 
 
302 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  46.76 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  51.53 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  46.76 
 
 
302 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.74 
 
 
343 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.44 
 
 
305 aa  271  9e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.84 
 
 
296 aa  271  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.25 
 
 
343 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.99 
 
 
304 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
301 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  49.5 
 
 
320 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  46.69 
 
 
342 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  45.6 
 
 
341 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  46.2 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  50.34 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.51 
 
 
321 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  48.12 
 
 
305 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  45.81 
 
 
345 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  45.74 
 
 
344 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.85 
 
 
308 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  44.79 
 
 
341 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.13 
 
 
322 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  47.9 
 
 
315 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  49.04 
 
 
334 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  46.37 
 
 
306 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2431  pseudouridine synthase, RluD  45.92 
 
 
351 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0293774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  45.48 
 
 
343 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  45.48 
 
 
343 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.78 
 
 
332 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  46.75 
 
 
315 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  46.37 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  47.47 
 
 
316 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  44.72 
 
 
326 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.15 
 
 
326 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  46.18 
 
 
343 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7584  pseudouridine synthase, RluA family  46.54 
 
 
337 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0816319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  49.21 
 
 
334 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  50 
 
 
313 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  46.89 
 
 
324 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.51 
 
 
313 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  45.55 
 
 
305 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  45.55 
 
 
305 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  48.2 
 
 
319 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  48.69 
 
 
332 aa  255  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  47.54 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  44.41 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  45.51 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  46.13 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  47.33 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  43.57 
 
 
336 aa  252  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>