27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4439 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7004  hypothetical protein  45.38 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0486  hypothetical protein  46.55 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.240352  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0011  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.808442  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0010  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2640  hypothetical protein  51.43 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2416  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3394  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2709  hypothetical protein  39.56 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6129  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  37.7 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  29 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  38.1 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  31.25 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  36.51 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  36.51 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  32.31 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  39.66 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3483  hypothetical protein  44.44 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  36.21 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  39.66 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  32.26 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4899  hypothetical protein  25.51 
 
 
148 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.348391  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  29.89 
 
 
84 aa  40.8  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  31.82 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>