More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4431 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
767 aa  1580    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
1676 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
945 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
3706 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1428 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
547 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1432 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
2693 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
613 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
1560 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1344 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.06 
 
 
796 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
732 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
1654 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
771 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1478 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
1246 aa  225  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
964 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
1051 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1070 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1070 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.07 
 
 
744 aa  204  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.32 
 
 
1210 aa  203  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.46 
 
 
746 aa  201  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.35 
 
 
892 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
1093 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
1093 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
815 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
488 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.34 
 
 
1239 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
572 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
941 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  27.99 
 
 
800 aa  187  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.11 
 
 
783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
526 aa  185  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
839 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  44.7 
 
 
1182 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.64 
 
 
886 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
1177 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
912 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.34 
 
 
754 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
780 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
1714 aa  177  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
1253 aa  177  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.24 
 
 
1248 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  57.66 
 
 
1081 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
1390 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.36 
 
 
819 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
551 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
913 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
631 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  31.25 
 
 
492 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  34.72 
 
 
682 aa  171  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
834 aa  170  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
1183 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
991 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.13 
 
 
945 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
439 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  41.04 
 
 
918 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
980 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  37.5 
 
 
449 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.66 
 
 
1047 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
681 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
788 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
347 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  32.82 
 
 
676 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
215 aa  160  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
1051 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
790 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
909 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
932 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
382 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 
1122 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  39.3 
 
 
704 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
1227 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
674 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
462 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.97 
 
 
1668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  38.67 
 
 
657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  37.39 
 
 
1289 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
727 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.83 
 
 
1663 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
746 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
437 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.13 
 
 
381 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
585 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.13 
 
 
936 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
382 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 
1418 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  140  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
771 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
782 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>