More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4418 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  100 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  60.7 
 
 
295 aa  359  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  61.35 
 
 
288 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  61.35 
 
 
288 aa  351  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  55.99 
 
 
287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  54.67 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  55 
 
 
293 aa  325  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  55.36 
 
 
291 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  44.04 
 
 
280 aa  208  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.24 
 
 
276 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  41.57 
 
 
281 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  36.04 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  41.18 
 
 
281 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.6 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.68 
 
 
281 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.54 
 
 
284 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  42.05 
 
 
282 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.97 
 
 
281 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.75 
 
 
276 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  40.07 
 
 
279 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  39.72 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35.48 
 
 
311 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.01 
 
 
362 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  42.5 
 
 
291 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  39.57 
 
 
283 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.63 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.63 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.29 
 
 
276 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  40.93 
 
 
304 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.5 
 
 
373 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.86 
 
 
303 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.71 
 
 
277 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.23 
 
 
355 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.71 
 
 
371 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.35 
 
 
277 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.35 
 
 
277 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.68 
 
 
280 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  40.43 
 
 
361 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.91 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.82 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.69 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.18 
 
 
364 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.14 
 
 
355 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.91 
 
 
387 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.55 
 
 
367 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.55 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  39.07 
 
 
365 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.18 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.46 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  36.82 
 
 
382 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.46 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.14 
 
 
367 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37.63 
 
 
274 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.36 
 
 
365 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.49 
 
 
360 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36.46 
 
 
365 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  40.5 
 
 
275 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.91 
 
 
358 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  35.61 
 
 
371 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  36.46 
 
 
365 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.93 
 
 
362 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  37.59 
 
 
413 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  38.85 
 
 
360 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  38.57 
 
 
355 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  35.13 
 
 
366 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.27 
 
 
366 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  35.38 
 
 
272 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  35.25 
 
 
371 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.25 
 
 
371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.64 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  39.21 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  35.87 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  35.02 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.21 
 
 
358 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.82 
 
 
368 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.27 
 
 
358 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.27 
 
 
358 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.86 
 
 
358 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.21 
 
 
360 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  36.27 
 
 
279 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.78 
 
 
363 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 
279 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.14 
 
 
286 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  35.13 
 
 
372 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.66 
 
 
381 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  35.74 
 
 
359 aa  158  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.51 
 
 
358 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
373 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  38.21 
 
 
315 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  38.21 
 
 
315 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  38.21 
 
 
315 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  36.82 
 
 
391 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  33.45 
 
 
269 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>