197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4411 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  54.67 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.25 
 
 
246 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  44.25 
 
 
246 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
247 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
246 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
250 aa  185  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
244 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.52 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
239 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
239 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
239 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 
254 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 
244 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
267 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 
244 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
244 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
238 aa  175  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
232 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
245 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
238 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
240 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.57 
 
 
232 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
239 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
232 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  40.89 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  41.52 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
231 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 
247 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.05 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  39.48 
 
 
274 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  37.72 
 
 
236 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.56 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 
230 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  37.5 
 
 
439 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
260 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
260 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
260 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.09 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  39.73 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  38.5 
 
 
312 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  38.5 
 
 
344 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
240 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.11 
 
 
236 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.95 
 
 
242 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  38.5 
 
 
269 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
239 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
245 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  39.39 
 
 
240 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  38.05 
 
 
269 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  38.84 
 
 
236 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
268 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
340 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
242 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
257 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  35.65 
 
 
252 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
238 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  37.45 
 
 
259 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
340 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.19 
 
 
235 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
248 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  35.93 
 
 
236 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
236 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
239 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
265 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  34.82 
 
 
236 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
255 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3375  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.32 
 
 
233 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4763  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.12 
 
 
237 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  36.4 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.07 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.37 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.744269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  35.71 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5598  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.76 
 
 
239 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
267 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.12 
 
 
384 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.67 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>