41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4400 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  80.34 
 
 
140 aa  196  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  80 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  83.48 
 
 
126 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  83.48 
 
 
126 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  80.87 
 
 
124 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  76.47 
 
 
137 aa  188  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  59.17 
 
 
134 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  57.63 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  56.3 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  56.9 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  56.52 
 
 
144 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  56.52 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  56.9 
 
 
134 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  52.54 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  51.72 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  50.85 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  52.25 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  50.85 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  53.15 
 
 
116 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  52.25 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  52.25 
 
 
118 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  52.25 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  51.35 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  48.65 
 
 
123 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  50.44 
 
 
129 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  48.25 
 
 
122 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  47.86 
 
 
122 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  50.88 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  49.55 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  51.35 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  42.06 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  45.79 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  43.64 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  47.66 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  43.93 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  46.73 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  42.06 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  41.44 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  41.28 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>