More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4363 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  100 
 
 
500 aa  987    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  52.15 
 
 
471 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  50.11 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  50.88 
 
 
479 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  48.77 
 
 
485 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  49.44 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  49.44 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  45.29 
 
 
474 aa  382  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  38.79 
 
 
469 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  37.89 
 
 
447 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  38.67 
 
 
479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  35.19 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  34.57 
 
 
481 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  34.16 
 
 
477 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  35 
 
 
472 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  34.16 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  34.38 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  34.62 
 
 
473 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.9 
 
 
435 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.9 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.53 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.73 
 
 
428 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.5 
 
 
446 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  32.01 
 
 
433 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.01 
 
 
428 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.14 
 
 
433 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.4 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.97 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.93 
 
 
433 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.93 
 
 
433 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.59 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.55 
 
 
431 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  32.05 
 
 
428 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.65 
 
 
427 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.34 
 
 
425 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.88 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.65 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.09 
 
 
425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.92 
 
 
435 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  33.03 
 
 
438 aa  190  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.9 
 
 
433 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  34.09 
 
 
425 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  34.09 
 
 
425 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.87 
 
 
436 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.77 
 
 
435 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.49 
 
 
488 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  34.2 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  33.94 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  30.84 
 
 
428 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.63 
 
 
439 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  32.53 
 
 
435 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.09 
 
 
438 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.1 
 
 
440 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  32.98 
 
 
451 aa  176  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  31.84 
 
 
431 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.98 
 
 
427 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  32.08 
 
 
484 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.37 
 
 
500 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.13 
 
 
437 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  28.4 
 
 
447 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.46 
 
 
448 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.59 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.83 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  29.31 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.11 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  30.08 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  27.7 
 
 
447 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.97 
 
 
439 aa  163  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  33.16 
 
 
436 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  32.27 
 
 
434 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  31.09 
 
 
437 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.5 
 
 
442 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.85 
 
 
437 aa  160  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.54 
 
 
427 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  31.11 
 
 
427 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.54 
 
 
435 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.76 
 
 
448 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.28 
 
 
428 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.88 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  31.45 
 
 
434 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.67 
 
 
434 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  31.44 
 
 
434 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  32.17 
 
 
434 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  32.17 
 
 
434 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  32.17 
 
 
434 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  30.37 
 
 
434 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  32.17 
 
 
434 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  31.13 
 
 
483 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  29.64 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.58 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.36 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.21 
 
 
441 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  31.11 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.36 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.36 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>