More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4149 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  100 
 
 		 498 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  46.09 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  42.12 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  37.71 
 
 		 737 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  37.71 
 
 		 721 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  37.71 
 
 		 721 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  36.38 
 
 		 663 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  33.76 
 
 		 491 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  33.8 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  27.92 
 
 		 684 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  27.92 
 
 		 701 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  27.47 
 
 		 675 aa  147  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  28.06 
 
 		 708 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 741 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 741 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 741 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  25.68 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  35.67 
 
 		 739 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 724 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 724 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 724 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 724 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  25.81 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  31.47 
 
 		 719 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 647 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 647 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 647 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  25.94 
 
 		 608 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  25.94 
 
 		 608 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  25.94 
 
 		 608 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 637 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  27.15 
 
 		 617 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  27.15 
 
 		 617 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  24.65 
 
 		 638 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  20.36 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  26.46 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5435  hypothetical protein  38 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  27.11 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.9 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.65 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  25.75 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.36 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  22.7 
 
 		 744 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.53 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.59 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.91 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.28 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25.76 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.64 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.21 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  24.57 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 		 339 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  24.49 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  22.9 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  22.48 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.02 
 
 		 297 aa  59.7  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>