28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4093 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 518 aa  1070    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.87 
 
 		 525 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.52 
 
 		 533 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.64 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.47 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  29.57 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.46 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.67 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.29 
 
 		 555 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.61 
 
 		 506 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.59 
 
 		 1540 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.7 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.87 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.13 
 
 		 555 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  24.42 
 
 		 516 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.64 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  29.59 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.12 
 
 		 573 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.46 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.94 
 
 		 540 aa  70.1  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.11 
 
 		 567 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.19 
 
 		 722 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  24.23 
 
 		 550 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.69 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.07 
 
 		 540 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  21.55 
 
 		 556 aa  50.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.55 
 
 		 484 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.98 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>