More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4084 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  100 
 
 		 356 aa  742    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  34.01 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  31.32 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  36.95 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  33.82 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  31.43 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  28.52 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  27.19 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  32.43 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  28.1 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  30.29 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  34.03 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.49 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  31.52 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.06 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  30.13 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.47 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  32.02 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  31.53 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.05 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.96 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  29 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  26.56 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  35.66 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.47 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  29.95 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.92 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  32.74 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  32.78 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.18 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.53 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  28.65 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.57 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.13 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  27.27 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  28.5 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  28.98 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  25.52 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.38 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.61 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  28.11 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.41 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.53 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.53 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.79 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.36 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.98 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.22 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.89 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.79 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.11 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.9 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  29.52 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.12 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.49 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.34 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  27 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.76 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.75 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  33.54 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.14 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.75 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.21 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.56 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.6 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.84 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.36 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  28.12 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.35 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  30.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.36 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.14 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.6 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  27.64 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.39 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.11 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.6 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1675  integrase family protein  29.95 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  27.03 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.67 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  25.27 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  30.16 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.86 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.88 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  27.5 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>