More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4076 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  100 
 
 
287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  61.75 
 
 
306 aa  363  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  60.78 
 
 
283 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  57.39 
 
 
283 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  61.27 
 
 
283 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  61.27 
 
 
283 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  57.75 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  54.42 
 
 
280 aa  320  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  45.3 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  44.18 
 
 
282 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.57 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.36 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  23.84 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.4 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.68 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.3 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.29 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.14 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.56 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  24.75 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.5 
 
 
173 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.53 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  26.57 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  34.07 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.2 
 
 
139 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  24.83 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  25.91 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  30.99 
 
 
151 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.82 
 
 
143 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  37.62 
 
 
152 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.07 
 
 
150 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  28.37 
 
 
162 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  28.57 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
141 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 
137 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
128 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.34 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.65 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.99 
 
 
288 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.46 
 
 
153 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  53.7 
 
 
137 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.59 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.78 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.57 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  24.45 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  26.57 
 
 
152 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.64 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.62 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  35.48 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  26.63 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  21.67 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.57 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26.9 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
137 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25.2 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  35.48 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
128 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  33.1 
 
 
141 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  27.66 
 
 
162 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.59 
 
 
290 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  27.97 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.61 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.47 
 
 
142 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.94 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
147 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  31.5 
 
 
141 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.43 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
145 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.72 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  28.95 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.17 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.46 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  23.26 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  23.91 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.61 
 
 
145 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.22 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  31.87 
 
 
177 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  42.62 
 
 
161 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.57 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.08 
 
 
142 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  24.92 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
151 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  44.83 
 
 
131 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.38 
 
 
157 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.74 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  46.3 
 
 
135 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>