138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4073 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  100 
 
 
122 aa  230  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  64.08 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  58.49 
 
 
111 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  63.11 
 
 
112 aa  129  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  56.48 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  56.48 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  51.33 
 
 
121 aa  118  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  50.5 
 
 
108 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  50.5 
 
 
108 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  58.42 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  51.92 
 
 
108 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  49.49 
 
 
109 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  51.79 
 
 
117 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  56.19 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  49.54 
 
 
112 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
118 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  57.55 
 
 
111 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  47.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  51.33 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  58.82 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  52.34 
 
 
110 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  50.46 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  50.93 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  47.31 
 
 
111 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  50.48 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  51.38 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  51.89 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000162308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  50.89 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  52.83 
 
 
108 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  49.07 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  48.18 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  53.4 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  51.89 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  51 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000116156  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  44 
 
 
110 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  44 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  56.84 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  49.06 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  41.07 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  40.54 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  41.07 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  56.84 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  56.84 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  42 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  48.94 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  48.18 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  50.44 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  48.18 
 
 
109 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  40.18 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  47.32 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  52.13 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  43.88 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  42.57 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  41.28 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  42.57 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  41.9 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  41.75 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  43.43 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  39.6 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  37 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  47.31 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  39.66 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  42.42 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  37.86 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  45.16 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  44.09 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  38.24 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  44.09 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  38.24 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  39.78 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  33.64 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  37.14 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  39.36 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  41.05 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1247  hypothetical protein  41.51 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.288271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  41.94 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  42.42 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  40 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  40 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21660  hypothetical protein  34.29 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  36.26 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  40.62 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  41.84 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  35.35 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>