56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3774 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  58.75 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  53.49 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  42.59 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  43.14 
 
 		 610 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  47.62 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  36 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1993  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.94 
 
 		 459 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0068  hypothetical protein  34.92 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0182  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0678  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  45.24 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  47.37 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  35.29 
 
 		 95 aa  42  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7348  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  38.78 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  45.24 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 402 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>