More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3626 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  100 
 
 
627 aa  1214    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  64.8 
 
 
525 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  56.4 
 
 
731 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  56.79 
 
 
635 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  50.74 
 
 
972 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  47.02 
 
 
578 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  47.02 
 
 
578 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  47.59 
 
 
565 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  46.4 
 
 
576 aa  250  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  40.07 
 
 
577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  34.38 
 
 
574 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  35.71 
 
 
594 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 
526 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  30.56 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  27.64 
 
 
505 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  30.07 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
460 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  27.78 
 
 
476 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  32.03 
 
 
461 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  27.15 
 
 
475 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  29.37 
 
 
475 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 
435 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  25.91 
 
 
477 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
1496 aa  97.8  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 
1470 aa  97.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 
467 aa  97.4  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.76 
 
 
491 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 
433 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 
482 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 
419 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  25 
 
 
606 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
462 aa  91.3  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 
427 aa  90.1  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 
535 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.49 
 
 
449 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 
445 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 
421 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.98 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  29.12 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.31 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.2 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  29.67 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.15 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
476 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 
419 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.56 
 
 
500 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
431 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.07 
 
 
463 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 
463 aa  73.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
447 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.85 
 
 
453 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 
452 aa  72  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
483 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.65 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 
449 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 
461 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  28.63 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 
496 aa  67  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.45 
 
 
520 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
489 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 
441 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
438 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
473 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
479 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.27 
 
 
479 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
482 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 
419 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
489 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
471 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 
442 aa  66.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  25.52 
 
 
496 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  27.98 
 
 
454 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
496 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>