More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3625 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  100 
 
 
525 aa  1023    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  68.21 
 
 
627 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  48.59 
 
 
731 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  47.89 
 
 
972 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  47.73 
 
 
635 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  43.59 
 
 
565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  41.18 
 
 
578 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  41.18 
 
 
578 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  43.26 
 
 
576 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  34.33 
 
 
577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  33.54 
 
 
594 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
574 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
526 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  26.23 
 
 
526 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  27.33 
 
 
476 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  26.4 
 
 
475 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  26.71 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  26.09 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
460 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 
1470 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 
433 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
470 aa  97.1  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 
435 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 
1496 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
467 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  27.61 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 
535 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.3 
 
 
458 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
482 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.67 
 
 
455 aa  87  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
441 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.3 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
420 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
443 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.57 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.69 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
495 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.22 
 
 
470 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.73 
 
 
463 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  23.31 
 
 
606 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
464 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  25.86 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.42 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25 
 
 
431 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.78 
 
 
553 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  24.24 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  24.03 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.24 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
435 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.19 
 
 
463 aa  70.1  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 
499 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.21 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  19.56 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 
448 aa  67  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 
483 aa  67  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.46 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.89 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
440 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 
438 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.53 
 
 
484 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.14 
 
 
479 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  21.56 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 
482 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>