More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3579 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1432 aa  2958    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1122 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.39 
 
 		 1081 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 3706 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.02 
 
 		 1418 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1428 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1344 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.73 
 
 		 759 aa  590  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.7 
 
 		 838 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.15 
 
 		 714 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.32 
 
 		 634 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.88 
 
 		 630 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 		 935 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.44 
 
 		 1021 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.89 
 
 		 873 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1070 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.7 
 
 		 576 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.13 
 
 		 703 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1222 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 760 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.79 
 
 		 1070 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.95 
 
 		 654 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.02 
 
 		 989 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46 
 
 		 647 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1057 aa  407  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1076 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.68 
 
 		 682 aa  383  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 		 712 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 		 926 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1501 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 2693 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 1148 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1086 aa  335  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1092 aa  326  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  29.03 
 
 		 1086 aa  325  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 822 aa  321  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1260 aa  318  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 821 aa  311  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 1342 aa  310  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1260 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 859 aa  308  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 1714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1059 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 1011 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 795 aa  303  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 853 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 962 aa  296  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 944 aa  296  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 941 aa  296  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  28.27 
 
 		 1065 aa  295  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 767 aa  294  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 860 aa  294  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1089 aa  294  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 1134 aa  293  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 642 aa  291  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1051 aa  291  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 		 922 aa  288  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 822 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 1108 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  29.68 
 
 		 1109 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 		 1268 aa  285  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 1113 aa  285  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1065 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 814 aa  281  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 622 aa  279  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 1509 aa  278  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 983 aa  278  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1191 aa  277  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 981 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 571 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.97 
 
 		 1121 aa  274  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1079 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 957 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 943 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1004 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1007 aa  272  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 991 aa  271  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1106 aa  270  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 769 aa  268  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 796 aa  268  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 845 aa  268  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 1013 aa  268  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 845 aa  268  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 673 aa  267  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 777 aa  267  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1275 aa  266  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 1102 aa  266  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 795 aa  265  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 1419 aa  264  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1309 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 776 aa  264  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 826 aa  262  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.47 
 
 		 916 aa  262  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 764 aa  262  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 796 aa  262  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 1381 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 810 aa  261  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 		 1140 aa  261  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 939 aa  261  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 1019 aa  259  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>