More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3478 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.93 
 
 
1213 aa  801    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  38.54 
 
 
1193 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1208 aa  2471    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.68 
 
 
1221 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.49 
 
 
1196 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.29 
 
 
1190 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  36.29 
 
 
1188 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 
1188 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  32.9 
 
 
1247 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.84 
 
 
1474 aa  459  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.26 
 
 
1411 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 
1443 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.89 
 
 
696 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.45 
 
 
1236 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.17 
 
 
1652 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
1163 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  36.45 
 
 
947 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  39.76 
 
 
1364 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
1831 aa  390  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.79 
 
 
1523 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.6 
 
 
1557 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.11 
 
 
1363 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.85 
 
 
1454 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.17 
 
 
1553 aa  360  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.15 
 
 
1510 aa  348  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
1481 aa  343  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  34.16 
 
 
1789 aa  343  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 
1686 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  37.95 
 
 
566 aa  331  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.1 
 
 
1868 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.64 
 
 
1711 aa  328  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.91 
 
 
1217 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.66 
 
 
1357 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.75 
 
 
1901 aa  313  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.65 
 
 
919 aa  311  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.24 
 
 
1807 aa  311  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.71 
 
 
1262 aa  308  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.18 
 
 
1760 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  35.47 
 
 
1656 aa  304  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.42 
 
 
1229 aa  300  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.98 
 
 
1552 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  32.69 
 
 
1176 aa  292  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.45 
 
 
1161 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.18 
 
 
1161 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.49 
 
 
1348 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.12 
 
 
1367 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.91 
 
 
1858 aa  278  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 
1177 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 
1211 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36.73 
 
 
1661 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.7 
 
 
1609 aa  269  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.32 
 
 
924 aa  257  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.18 
 
 
930 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  30.48 
 
 
1264 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.07 
 
 
1714 aa  248  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  30.48 
 
 
1264 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.26 
 
 
728 aa  248  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.92 
 
 
1016 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1164 aa  247  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.15 
 
 
1599 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.78 
 
 
1016 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.79 
 
 
1598 aa  244  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.46 
 
 
1607 aa  243  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.08 
 
 
1242 aa  241  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 
1399 aa  237  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.29 
 
 
1583 aa  237  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.13 
 
 
1416 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  38.08 
 
 
344 aa  234  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.34 
 
 
1190 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  37.77 
 
 
344 aa  234  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.58 
 
 
1344 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.52 
 
 
1856 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.2 
 
 
1626 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.61 
 
 
1766 aa  229  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 
1878 aa  228  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  27.17 
 
 
1280 aa  228  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 
1209 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.22 
 
 
1684 aa  224  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.05 
 
 
1547 aa  224  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 
1209 aa  224  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.94 
 
 
608 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
1311 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
1304 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.81 
 
 
1330 aa  220  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.33 
 
 
740 aa  220  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  35.75 
 
 
464 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.46 
 
 
1599 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 
438 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  28.78 
 
 
464 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.68 
 
 
505 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  30.43 
 
 
1041 aa  213  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.85 
 
 
1214 aa  210  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 
1427 aa  210  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  31.94 
 
 
471 aa  209  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.12 
 
 
1484 aa  208  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.52 
 
 
1617 aa  208  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.87 
 
 
1823 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.07 
 
 
676 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.64 
 
 
1039 aa  207  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.74 
 
 
677 aa  206  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>