133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3426 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  100 
 
 
456 aa  936    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  58.42 
 
 
456 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  59.56 
 
 
458 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  57.68 
 
 
457 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  55.26 
 
 
456 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  55.04 
 
 
456 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  53.42 
 
 
440 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  52.01 
 
 
445 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  51.66 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.64 
 
 
428 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.6 
 
 
429 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.65 
 
 
428 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.41 
 
 
433 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.96 
 
 
435 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.53 
 
 
435 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.45 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.61 
 
 
433 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.16 
 
 
433 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.32 
 
 
433 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.56 
 
 
377 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  24.76 
 
 
370 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.92 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  23.9 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  31.48 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  30 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  25 
 
 
340 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.81 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  23.26 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  45.35 
 
 
458 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  45.59 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  43.02 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  50 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  46.43 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  31.62 
 
 
337 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.17 
 
 
311 aa  53.9  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  30.88 
 
 
337 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  27.19 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  43.68 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  49.09 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 
461 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 
396 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  45 
 
 
464 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.94 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  34.69 
 
 
514 aa  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  50 
 
 
418 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 
451 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  41.86 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  46.3 
 
 
267 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  42.19 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  40.23 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  32.63 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  50 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  50 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  39.13 
 
 
225 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  53.19 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.54 
 
 
415 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
232 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  47.06 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  48.08 
 
 
448 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  45.28 
 
 
413 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 
464 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 
455 aa  47  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  41.38 
 
 
412 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.64 
 
 
283 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
571 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
77 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  56.41 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  25 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  25 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  25 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.4 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  25.73 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  45.1 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  36.71 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.65 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  32.65 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  40 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.65 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
116 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.24 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  24.06 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  43.14 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  41.82 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.62 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
223 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.82 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>