More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3411 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  87.95 
 
 
228 aa  407  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.55 
 
 
224 aa  350  9e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  73.54 
 
 
224 aa  339  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  65.18 
 
 
226 aa  305  5e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.28 
 
 
225 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  2.06018e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.91 
 
 
228 aa  253  2e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  57.78 
 
 
236 aa  253  2e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 
224 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 
224 aa  251  8e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 
225 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.09 
 
 
227 aa  248  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.73 
 
 
227 aa  247  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 
231 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  54.63 
 
 
230 aa  244  1e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
230 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 
227 aa  240  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
230 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 
231 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
230 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 
229 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 
228 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 
228 aa  238  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  53.81 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 
227 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56.44 
 
 
226 aa  234  1e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 
224 aa  233  1e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  53.36 
 
 
224 aa  234  1e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
225 aa  234  1e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  51.74 
 
 
235 aa  231  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 
223 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.28 
 
 
237 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 
244 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  50.44 
 
 
240 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 
240 aa  228  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  51.33 
 
 
227 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  51.33 
 
 
227 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  51.33 
 
 
227 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
228 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 
225 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
223 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
226 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 
226 aa  225  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 
227 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 
233 aa  224  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
225 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.01655e-08 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
235 aa  222  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.11 
 
 
236 aa  221  5e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 
246 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
228 aa  220  1e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 
224 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 
246 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.22 
 
 
238 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 
224 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  47.75 
 
 
236 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
224 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
406 aa  214  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 
245 aa  214  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  48.86 
 
 
224 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
242 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.33 
 
 
252 aa  214  1e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
224 aa  213  1e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  48.4 
 
 
224 aa  213  1e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
229 aa  213  2e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.6 
 
 
227 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
242 aa  213  2e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 
224 aa  213  2e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
272 aa  212  3e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  55.16 
 
 
228 aa  213  3e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 
224 aa  212  3e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  53.36 
 
 
234 aa  213  3e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  48.46 
 
 
241 aa  212  4e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 
273 aa  212  4e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
248 aa  212  4e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
239 aa  211  6e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.96 
 
 
239 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  50 
 
 
229 aa  211  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 
254 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
228 aa  211  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.25236e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 
223 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 
229 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 
229 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 
231 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  47.49 
 
 
224 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
228 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 
229 aa  207  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 
223 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.12 
 
 
229 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 
227 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.06961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
239 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
224 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 
230 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  47.03 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  47.03 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 
229 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.1064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 
222 aa  205  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.09 
 
 
223 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 
235 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>