More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3404 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  65.82 
 
 		 713 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  66.35 
 
 		 653 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  68.23 
 
 		 687 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  80.39 
 
 		 808 aa  695    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  67.75 
 
 		 645 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  68.56 
 
 		 682 aa  784    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  66.35 
 
 		 653 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 669 aa  1348    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  69.42 
 
 		 646 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  69.17 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  69.17 
 
 		 646 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  58.02 
 
 		 624 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  53.91 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  51.51 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  63.73 
 
 		 606 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  62.29 
 
 		 608 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  62.59 
 
 		 605 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  62.5 
 
 		 602 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.11 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  40.13 
 
 		 564 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 494 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.31 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.53 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  41.1 
 
 		 702 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40.43 
 
 		 543 aa  286  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  40.39 
 
 		 908 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  40.99 
 
 		 496 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.53 
 
 		 416 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  39.85 
 
 		 1080 aa  280  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  36.19 
 
 		 1041 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.61 
 
 		 476 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.22 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  39.27 
 
 		 1093 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  40.98 
 
 		 1427 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  38.01 
 
 		 1058 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 1123 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  40.36 
 
 		 1334 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  37.68 
 
 		 1022 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  39.5 
 
 		 1194 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  38.93 
 
 		 952 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  39.44 
 
 		 922 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  37.03 
 
 		 1043 aa  266  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  41.15 
 
 		 636 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  37.77 
 
 		 483 aa  266  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.81 
 
 		 496 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  37.23 
 
 		 1024 aa  266  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.81 
 
 		 496 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.46 
 
 		 492 aa  266  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  38.35 
 
 		 990 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  37.2 
 
 		 1093 aa  265  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  39.19 
 
 		 944 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  37.44 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  39.27 
 
 		 1113 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  39.27 
 
 		 1151 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  40.2 
 
 		 1070 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  37.81 
 
 		 1040 aa  263  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.28 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  42.6 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  38.96 
 
 		 1048 aa  261  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 974 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42.27 
 
 		 496 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.01 
 
 		 496 aa  260  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  38.5 
 
 		 1244 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  36.51 
 
 		 1117 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  37.9 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.08 
 
 		 489 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  36.45 
 
 		 961 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  38.08 
 
 		 489 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.08 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  38.75 
 
 		 717 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  39.29 
 
 		 959 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  37.69 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  38.38 
 
 		 1265 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  37.31 
 
 		 465 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.55 
 
 		 497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  35.65 
 
 		 1016 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.29 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.27 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  38.17 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.38 
 
 		 528 aa  252  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  36.8 
 
 		 1091 aa  252  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  39.63 
 
 		 928 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  36.81 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.34 
 
 		 492 aa  251  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  38.62 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  37.69 
 
 		 987 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.62 
 
 		 1128 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  37.69 
 
 		 991 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  37.69 
 
 		 991 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.27 
 
 		 1012 aa  250  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  37.87 
 
 		 1120 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  38.15 
 
 		 490 aa  250  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  39.45 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  38.14 
 
 		 1082 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  35.46 
 
 		 926 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.42 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  35.46 
 
 		 953 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.62 
 
 		 485 aa  248  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.32 
 
 		 1073 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>