64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3195 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 1125 aa  2321    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  32.73 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1098 aa  254  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  25.12 
 
 		 1059 aa  229  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  25.45 
 
 		 1064 aa  225  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  25.39 
 
 		 1049 aa  218  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  23.3 
 
 		 1047 aa  199  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.46 
 
 		 1116 aa  161  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  25.33 
 
 		 1021 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  24.28 
 
 		 1024 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  24.82 
 
 		 1847 aa  139  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  23.63 
 
 		 1560 aa  139  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  26.48 
 
 		 1100 aa  138  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  24.04 
 
 		 1005 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  22.67 
 
 		 1615 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 1613 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  32.76 
 
 		 1121 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  23.57 
 
 		 1636 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  22.16 
 
 		 1609 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 1632 aa  91.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  23.95 
 
 		 1063 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  28.48 
 
 		 1301 aa  61.6  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.79 
 
 		 703 aa  57  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 908 aa  56.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24.54 
 
 		 416 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1282 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 475 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 489 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  29.48 
 
 		 519 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  29.68 
 
 		 1189 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  33.61 
 
 		 1002 aa  53.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  27.83 
 
 		 732 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  21.89 
 
 		 576 aa  52.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.34 
 
 		 1055 aa  49.7  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  23.57 
 
 		 489 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.9 
 
 		 995 aa  48.9  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25.76 
 
 		 489 aa  48.9  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  25.85 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  37.31 
 
 		 573 aa  48.5  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  22.3 
 
 		 555 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.23 
 
 		 1058 aa  48.5  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.91 
 
 		 1239 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  40.32 
 
 		 673 aa  48.5  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1339 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1184 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  25.3 
 
 		 621 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  33.04 
 
 		 866 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  22.43 
 
 		 489 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  25.88 
 
 		 489 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 676 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 676 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  29.13 
 
 		 725 aa  46.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 710 aa  45.8  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.71 
 
 		 477 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  26.23 
 
 		 493 aa  45.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  33.98 
 
 		 1132 aa  45.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25 
 
 		 479 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.25 
 
 		 974 aa  45.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 493 aa  45.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 587 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.12 
 
 		 490 aa  45.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 493 aa  45.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  25.56 
 
 		 489 aa  44.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>