More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3164 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
115 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  54.81 
 
 
128 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  54.13 
 
 
129 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0149  thioredoxin domain-containing protein  53.85 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.55638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  45.13 
 
 
114 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  44.55 
 
 
112 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  44.55 
 
 
112 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  45.1 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43.14 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.53 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  38.24 
 
 
107 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  35.29 
 
 
150 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44.3 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.05 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  37.62 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  40.91 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  37.96 
 
 
293 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  40.91 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  37.76 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  37.14 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  38.83 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.13 
 
 
109 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  43.21 
 
 
108 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.84 
 
 
293 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  38.61 
 
 
160 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  39.77 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  37.14 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.77 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.65 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.51 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.51 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  37.37 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.24 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  39.02 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  41.86 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  33.02 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  32.38 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  40 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  37.8 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  33.33 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  40.91 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  38.75 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.51 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.51 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  38.46 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  38.75 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  32.65 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.38 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  37.8 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.38 
 
 
918 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  37.65 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  41.18 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  38.75 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  29.52 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  34.26 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  36.47 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  32.65 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  37.63 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  29.7 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  35.78 
 
 
304 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.38 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  29.7 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  35.78 
 
 
304 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  36.9 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.38 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  37.65 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.38 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.38 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  28.57 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  33.02 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  36.36 
 
 
282 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  36.71 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  36.36 
 
 
282 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.86 
 
 
303 aa  76.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  32.67 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  37.65 
 
 
106 aa  76.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  33.65 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.37 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  38.1 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  37.97 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>