132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3144 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
412 aa  855  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  30.26 
 
 
397 aa  162  8e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  50.35 
 
 
577 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.92 
 
 
429 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  25.71 
 
 
436 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  29.38 
 
 
420 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  29.72 
 
 
432 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  29.88 
 
 
422 aa  134  4e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 
416 aa  134  4e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  28.94 
 
 
385 aa  131  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.79 
 
 
428 aa  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  28.7 
 
 
425 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  23.68 
 
 
418 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  23.68 
 
 
418 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  27.02 
 
 
383 aa  126  8e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  27.02 
 
 
423 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  27.22 
 
 
412 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  25.97 
 
 
440 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  26.22 
 
 
549 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  27.52 
 
 
422 aa  120  4e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  25.4 
 
 
438 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  27.25 
 
 
412 aa  118  2e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.11 
 
 
447 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  26.83 
 
 
451 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  25.7 
 
 
380 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.98 
 
 
419 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  23.13 
 
 
412 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  25.73 
 
 
414 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  24.05 
 
 
404 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  26.58 
 
 
415 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  24.6 
 
 
416 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  36.04 
 
 
427 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  24.5 
 
 
424 aa  103  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  27.51 
 
 
483 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  24 
 
 
417 aa  99.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  22.46 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  22.46 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  26.33 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  24.4 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  34.57 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  23.66 
 
 
485 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.09 
 
 
373 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  26.89 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  36.09 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.84 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.47 
 
 
620 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  21.12 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 
285 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.3 
 
 
378 aa  84.7  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  24.02 
 
 
412 aa  84.3  4e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  25.29 
 
 
351 aa  82.8  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  23.35 
 
 
438 aa  80.9  4e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  29.58 
 
 
561 aa  77.8  4e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  7.95371e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.56 
 
 
471 aa  77  5e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 
413 aa  76.6  6e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  23.73 
 
 
400 aa  76.6  8e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.25 
 
 
400 aa  76.3  8e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  23.48 
 
 
401 aa  76.3  1e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  23.42 
 
 
391 aa  74.7  3e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  37.11 
 
 
428 aa  73.2  8e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  22.89 
 
 
398 aa  71.6  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.09 
 
 
425 aa  70.5  6e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  21.28 
 
 
375 aa  70.1  7e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  26.53 
 
 
429 aa  67.4  5e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  20.59 
 
 
425 aa  66.6  7e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.6 
 
 
384 aa  66.6  7e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  26 
 
 
363 aa  64.7  3e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  29.01 
 
 
392 aa  62.4  2e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  22.64 
 
 
405 aa  62  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  25.25 
 
 
476 aa  61.6  2e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  21.8 
 
 
416 aa  60.8  4e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  23.33 
 
 
464 aa  60.1  8e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  23.17 
 
 
371 aa  58.5  2e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  18.28 
 
 
428 aa  58.9  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  21.61 
 
 
435 aa  57.8  4e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  24.49 
 
 
393 aa  57.4  5e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.92 
 
 
400 aa  56.6  8e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  22.79 
 
 
453 aa  55.8  1e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  21.83 
 
 
409 aa  55.1  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  24.16 
 
 
457 aa  55.5  2e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  21.05 
 
 
456 aa  55.5  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  21.83 
 
 
426 aa  54.7  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  23 
 
 
473 aa  54.3  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  21.79 
 
 
416 aa  54.7  3e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  26.37 
 
 
477 aa  53.9  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.7 
 
 
456 aa  53.5  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  20.1 
 
 
405 aa  53.1  8e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0040  restriction-modification enzyme subunit s3a  30 
 
 
372 aa  53.1  8e-06  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0522579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  24.67 
 
 
400 aa  53.1  9e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.33 
 
 
415 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.3 
 
 
401 aa  52.8  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.79 
 
 
453 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0041  restriction-modification enzyme subunit s3b  27.63 
 
 
406 aa  51.6  2e-05  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.370047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  22.53 
 
 
456 aa  51.6  2e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.83 
 
 
462 aa  51.2  3e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  20.65 
 
 
374 aa  51.6  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.62 
 
 
390 aa  51.6  3e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.26 
 
 
457 aa  50.8  5e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  21.78 
 
 
395 aa  50.8  5e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.55 
 
 
427 aa  50.8  5e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>