181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3075 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
388 aa  802  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  40.64 
 
 
413 aa  286  6e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  34.01 
 
 
415 aa  212  8e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  34.04 
 
 
419 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  4.06123e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  33.17 
 
 
419 aa  209  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  57.04 
 
 
416 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  52.8 
 
 
418 aa  182  9e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  52.8 
 
 
418 aa  182  9e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  42.06 
 
 
453 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  34.24 
 
 
393 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  41.45 
 
 
410 aa  173  6e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.35 
 
 
404 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.27 
 
 
413 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  31.77 
 
 
427 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.54 
 
 
442 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  46.71 
 
 
397 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  30.54 
 
 
364 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  28.97 
 
 
374 aa  148  2e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.22 
 
 
205 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  47.79 
 
 
385 aa  141  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  31.49 
 
 
419 aa  139  8e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  36.97 
 
 
422 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  31.55 
 
 
415 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  36.57 
 
 
414 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  35.29 
 
 
443 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  30.66 
 
 
402 aa  130  5e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  37.12 
 
 
562 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  34.48 
 
 
405 aa  118  2e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  24.93 
 
 
351 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  31.74 
 
 
412 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  24.77 
 
 
425 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 
417 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  36.05 
 
 
373 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  25.65 
 
 
420 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  9.62716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  22.37 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.58 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12768  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS.1  53.33 
 
 
91 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.24 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.83 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  22.81 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  23.11 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.47 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  30.46 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  24.24 
 
 
456 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 
834 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  34.97 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  32.77 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.87 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  26.5 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  30.21 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.26 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  24.74 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.53 
 
 
493 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  22.91 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.23 
 
 
422 aa  85.5  1e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  26.27 
 
 
401 aa  85.1  2e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 
392 aa  84.7  3e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.62 
 
 
457 aa  83.6  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 
442 aa  80.9  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  24.36 
 
 
426 aa  80.1  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  29.1 
 
 
415 aa  79  1e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  22.77 
 
 
360 aa  77.8  3e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  30.5 
 
 
363 aa  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  25.64 
 
 
428 aa  77  6e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  28.16 
 
 
444 aa  75.9  1e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  25.1 
 
 
417 aa  75.1  2e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.77 
 
 
386 aa  75.1  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  24.76 
 
 
417 aa  74.7  2e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.92 
 
 
423 aa  75.5  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  24.83 
 
 
374 aa  75.1  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  26.82 
 
 
411 aa  74.7  3e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 
399 aa  74.3  3e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2726  restriction modification system DNA specificity subunit  22.51 
 
 
500 aa  72.8  9e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.27 
 
 
384 aa  72.4  1e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  22.11 
 
 
390 aa  71.6  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.47 
 
 
385 aa  71.2  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  25.95 
 
 
435 aa  71.2  3e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59098e-06 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.54 
 
 
425 aa  70.5  5e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  24.34 
 
 
402 aa  70.1  6e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  23.97 
 
 
432 aa  69.7  7e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.76 
 
 
439 aa  70.1  7e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  26.03 
 
 
427 aa  69.7  7e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  27.98 
 
 
413 aa  69.7  8e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  22.65 
 
 
433 aa  69.7  9e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  22.43 
 
 
405 aa  68.9  1e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  24.43 
 
 
423 aa  69.3  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  24.43 
 
 
383 aa  69.3  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  30.25 
 
 
395 aa  68.9  1e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  29.01 
 
 
409 aa  68.6  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.03 
 
 
465 aa  68.2  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.53 
 
 
419 aa  68.2  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.16 
 
 
444 aa  68.2  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  28.57 
 
 
495 aa  68.2  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1852  anti-codon nuclease masking agent  27.81 
 
 
165 aa  67  6e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  27.17 
 
 
400 aa  66.6  7e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  22.34 
 
 
394 aa  66.6  7e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.37 
 
 
456 aa  66.6  8e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  25.26 
 
 
417 aa  65.9  1e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  23.2 
 
 
390 aa  66.2  1e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.69296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  24.41 
 
 
429 aa  65.5  2e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>