More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2941 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 652 aa  1316    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 684 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  47.78 
 
 		 1629 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 509 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.43 
 
 		 799 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 614 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 613 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.87 
 
 		 635 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 224 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 224 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 224 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 635 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.66 
 
 		 226 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  33.27 
 
 		 597 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 225 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 225 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 225 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  48.96 
 
 		 725 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 224 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 676 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.71 
 
 		 665 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 230 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 234 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 240 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 222 aa  197  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 225 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 231 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 224 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 225 aa  189  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.49 
 
 		 237 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 231 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 231 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 220 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 220 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 224 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 225 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 225 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 228 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 224 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 220 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 227 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 233 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 238 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 220 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  45.93 
 
 		 224 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 257 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  40 
 
 		 219 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  39.56 
 
 		 224 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 221 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 227 aa  178  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 224 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 228 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 220 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 225 aa  177  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.11 
 
 		 244 aa  177  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  38.99 
 
 		 229 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  43.44 
 
 		 253 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 236 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 220 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 246 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  43.95 
 
 		 221 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 220 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 283 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 235 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 223 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 219 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  41.08 
 
 		 244 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 223 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  40 
 
 		 225 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  174  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 242 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 226 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 228 aa  174  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 223 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.46 
 
 		 226 aa  173  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 221 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 226 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 236 aa  173  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.83 
 
 		 218 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 220 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  42.08 
 
 		 219 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 232 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 227 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 233 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.21 
 
 		 227 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 227 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 228 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  172  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 231 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 225 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  41.23 
 
 		 226 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>