62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2720 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  100 
 
 
54 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  76.47 
 
 
59 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  71.15 
 
 
58 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  71.15 
 
 
58 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  75 
 
 
56 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  73.08 
 
 
56 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  72.55 
 
 
56 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  54.72 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  48 
 
 
50 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  48 
 
 
50 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  46 
 
 
50 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  50 
 
 
50 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  46 
 
 
50 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  48 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  48 
 
 
50 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  52.38 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  48 
 
 
50 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  48 
 
 
50 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  59.52 
 
 
47 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  59.52 
 
 
47 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  56.41 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  57.14 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  60.98 
 
 
47 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  59.52 
 
 
46 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  57.14 
 
 
47 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  53.85 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  47.92 
 
 
50 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  57.14 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  54.76 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  54.76 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  52.27 
 
 
45 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  54.76 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  57.14 
 
 
46 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  53.66 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  51.22 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  57.14 
 
 
46 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  62.5 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  51.11 
 
 
48 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  58.14 
 
 
51 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  47.62 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  52.38 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  52.38 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  52.38 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  51.28 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  48.78 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  46.94 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  46.34 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  55 
 
 
48 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  45.24 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  57.5 
 
 
388 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.98 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  55 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  52.5 
 
 
59 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  46.94 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  45.24 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  37.5 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  55 
 
 
59 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14781  high light inducible protein  67.86 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  61.29 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  67.86 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  67.86 
 
 
81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>