More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2706 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  70.49 
 
 
305 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  69.64 
 
 
304 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  68.2 
 
 
303 aa  431  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  68.09 
 
 
305 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  68.09 
 
 
305 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  68.65 
 
 
304 aa  425  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  52.35 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  50.5 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  54 
 
 
306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  52.54 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  52.35 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  52.33 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  52 
 
 
305 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  50.5 
 
 
317 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  50.5 
 
 
304 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  50.5 
 
 
304 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  50.5 
 
 
304 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  50.66 
 
 
316 aa  291  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 
306 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  48.05 
 
 
323 aa  285  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  49.83 
 
 
300 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  49.5 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.84 
 
 
304 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  48 
 
 
306 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  48.83 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  47.67 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  47.67 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  47.64 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  46.58 
 
 
306 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  46.15 
 
 
304 aa  271  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  47.57 
 
 
300 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 
299 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  46.82 
 
 
302 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  47.67 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  44.48 
 
 
300 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  47.16 
 
 
305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  44.82 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  45.27 
 
 
298 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  46.88 
 
 
299 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  46.46 
 
 
300 aa  261  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  45.39 
 
 
297 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  45.39 
 
 
308 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  44.48 
 
 
294 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  46.62 
 
 
298 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 
307 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  45.69 
 
 
324 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  46.62 
 
 
299 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  41.91 
 
 
307 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  43.42 
 
 
305 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  45.61 
 
 
311 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.28 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.24 
 
 
307 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  45.07 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  43.66 
 
 
323 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  44.95 
 
 
315 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  39.8 
 
 
300 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  42.37 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  52.73 
 
 
224 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  41.45 
 
 
299 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  40.6 
 
 
298 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  43.34 
 
 
299 aa  235  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  43.04 
 
 
318 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  43.36 
 
 
311 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  44.67 
 
 
305 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  41.2 
 
 
299 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  40.67 
 
 
298 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  40.47 
 
 
305 aa  225  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  41.89 
 
 
323 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  41.08 
 
 
337 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  41.61 
 
 
299 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  41.03 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 
333 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  40.82 
 
 
294 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  41.32 
 
 
335 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  39.51 
 
 
324 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  38.78 
 
 
306 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  38.36 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  38.75 
 
 
296 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 
357 aa  188  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  32.98 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  32.98 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 
388 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  30.82 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  30.82 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  30.49 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.49 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.96 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  31.03 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  30.49 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  27.9 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  29.81 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  31.41 
 
 
378 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>