135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2685 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 424 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  45.74 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  43.8 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  38.71 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 		 454 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  35.5 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  36.36 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.92 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  26.23 
 
 		 493 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 487 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.38 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  25.61 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  25.55 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  25.55 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  25.55 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  25.55 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.77 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 504 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.12 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.12 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.12 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.12 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.84 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.12 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.12 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.75 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.62 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 509 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 476 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 479 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  27.25 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  29.18 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 497 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 503 aa  93.2  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 514 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 487 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  25.33 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  20.25 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  20.25 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 480 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.03 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.1 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.42 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.19 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24.14 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.15 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.21 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  23.68 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  23.36 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  21.99 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>