224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2672 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.53 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 
104 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 
104 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  42 
 
 
115 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  41.75 
 
 
111 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.81 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  40.43 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.38 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  33.02 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  39.08 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  32.99 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  35.29 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  33.65 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.57 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  37.07 
 
 
250 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
123 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.57 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.28 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  27.55 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.48 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.27 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.27 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  35.79 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 
269 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  26.53 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.53 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.55 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.74 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.52 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.14 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.59 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.11 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  34.48 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  26.25 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
116 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>