163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2586 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  100 
 
 
358 aa  739    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  49.27 
 
 
332 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  51.08 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  51.04 
 
 
336 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  49.56 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.15 
 
 
343 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  41.84 
 
 
334 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  43.49 
 
 
327 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  38.57 
 
 
624 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  41.76 
 
 
639 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  41.59 
 
 
330 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  40.74 
 
 
346 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  39.77 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  38.92 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.43 
 
 
346 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.08 
 
 
631 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  37.43 
 
 
347 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  40.57 
 
 
342 aa  248  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  38.11 
 
 
348 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.19 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.7 
 
 
348 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  38.7 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  36.86 
 
 
640 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.98 
 
 
347 aa  242  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  37.46 
 
 
370 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  38.26 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  35.77 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  37.32 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  37.61 
 
 
348 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  35.09 
 
 
370 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  34.76 
 
 
346 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  35 
 
 
370 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  35.04 
 
 
369 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  35 
 
 
370 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.6 
 
 
370 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  33.6 
 
 
370 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.18 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.04 
 
 
347 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.15 
 
 
364 aa  222  8e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.6 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  33.33 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.07 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  33.33 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  34.62 
 
 
365 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.14 
 
 
367 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  35.68 
 
 
374 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.31 
 
 
368 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.23 
 
 
350 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  34.91 
 
 
370 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.06 
 
 
367 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  34.32 
 
 
365 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  36.24 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.37 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  35.92 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  34.05 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  36.12 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  35.92 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.5 
 
 
365 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  35.92 
 
 
365 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.5 
 
 
371 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.5 
 
 
371 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.15 
 
 
368 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  34.23 
 
 
369 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.14 
 
 
375 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  34.86 
 
 
346 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  36.23 
 
 
344 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  34.94 
 
 
350 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  35.94 
 
 
375 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.23 
 
 
345 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  33.15 
 
 
369 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  33.51 
 
 
371 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  33.43 
 
 
341 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  34.32 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  31.64 
 
 
368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  34.54 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  34.77 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  32.52 
 
 
371 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  34.47 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  38.01 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  37.61 
 
 
386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  36.52 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  31.81 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  32.35 
 
 
368 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  31.1 
 
 
368 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  36.47 
 
 
341 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  32.35 
 
 
368 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  32.08 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.16 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  36.07 
 
 
340 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.78 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  33.72 
 
 
351 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  34.4 
 
 
369 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.15 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  34.12 
 
 
342 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 
365 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  34.01 
 
 
345 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  34.01 
 
 
345 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  32.94 
 
 
367 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  34.01 
 
 
350 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>