More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2547 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 325 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  57.73 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  57.1 
 
 		 326 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  55.17 
 
 		 356 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  55.17 
 
 		 356 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.57 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  55.77 
 
 		 354 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  48.53 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.39 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  33.97 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  33.23 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.97 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.44 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.36 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  27.18 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.88 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  29.68 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  27.55 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.05 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  28.23 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  27.89 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.73 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.96 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  25.25 
 
 		 362 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.51 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  25.08 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.65 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.16 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.4 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  29.1 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 830 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 815 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  25.5 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  36.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  24.39 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.11 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.8 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.8 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.51 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  23.94 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.88 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.62 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.36 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  22.36 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.75 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  29.53 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.83 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.85 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.14 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  25.4 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  41.58 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.61 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.24 
 
 		 821 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  25.75 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 843 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.81 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.23 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  32.26 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.38 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 830 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  25.9 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 830 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.46 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  25.38 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  25.62 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.46 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  24.71 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  23.84 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.88 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0230  folate-binding protein YgfZ  26.11 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.34 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.61 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.08 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 815 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.04 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0872  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.08 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.21 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  25.63 
 
 		 819 aa  69.3  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  25.79 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 835 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 827 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  38.32 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.75 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.46 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.32 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  26.67 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  24.85 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  24.85 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  25.16 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>