22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2520 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  41.1 
 
 
287 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  40.57 
 
 
389 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  35.44 
 
 
260 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  44.79 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  44.79 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  40 
 
 
362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  40 
 
 
362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  39.77 
 
 
191 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  37.43 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  28.95 
 
 
209 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  29.41 
 
 
196 aa  98.2  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  32.98 
 
 
380 aa  95.9  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  31.18 
 
 
247 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  28.41 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  33.95 
 
 
626 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5048  hypothetical protein  29.36 
 
 
570 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.237947  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3317  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  65.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  24.04 
 
 
242 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  27.16 
 
 
245 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.37 
 
 
2800 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  24.84 
 
 
1888 aa  43.9  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>