More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2503 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
370 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.77 
 
 
366 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.78 
 
 
371 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.24 
 
 
375 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
386 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
360 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 
360 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.12 
 
 
366 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.57 
 
 
348 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
347 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.19 
 
 
351 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.24 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.39 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.4 
 
 
354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.25 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 
336 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.21 
 
 
344 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.56 
 
 
342 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.4 
 
 
337 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.21 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.55 
 
 
336 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 
338 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.95 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.64 
 
 
541 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.14 
 
 
354 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 
338 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
356 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.06 
 
 
356 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
356 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
336 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
336 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
353 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  391  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.94 
 
 
355 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 
333 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 
345 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 
336 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 
338 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.45 
 
 
352 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
339 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 
344 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
338 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 
347 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  58.39 
 
 
336 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 
334 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.73 
 
 
356 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 
352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
354 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 
336 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
338 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
353 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 
352 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
341 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
335 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
338 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
340 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 
354 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.19 
 
 
336 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 
344 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 
353 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 
354 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 
355 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.24 
 
 
363 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.45 
 
 
343 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 
338 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 
335 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 
355 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
334 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
363 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
356 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
336 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.52 
 
 
334 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
350 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 
330 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 
333 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>