More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2413 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  100 
 
 		 351 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3083  periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.03 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  29.08 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 662 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  21.8 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  21.8 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  21.8 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.61 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.13 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.61 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  21.51 
 
 		 320 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.61 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  22.79 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  21.22 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  23.55 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  21.77 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  22.11 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.57 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  29.43 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.82 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  26.26 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.4 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  28.62 
 
 		 307 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  28.57 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.57 
 
 		 300 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.91 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.37 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  35.48 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.81 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  25.16 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  23.42 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.41 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  25.7 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  33.11 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>