More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2410 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
837 aa  1696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  44.71 
 
 
860 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  39.93 
 
 
850 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 
862 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 
843 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  38.69 
 
 
864 aa  512  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  40.81 
 
 
817 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 
815 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  39.29 
 
 
825 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  39.16 
 
 
825 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 
859 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  38.61 
 
 
689 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 
708 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
711 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 
821 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 
741 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.58 
 
 
709 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 
734 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
709 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
708 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 
829 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 
736 aa  340  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 
730 aa  340  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
799 aa  337  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 
819 aa  334  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 
710 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 
732 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 
738 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.46 
 
 
703 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
714 aa  333  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 
722 aa  332  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
806 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
730 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.55 
 
 
708 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 
778 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.85 
 
 
711 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 
701 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 
689 aa  324  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.47 
 
 
801 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 
715 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
726 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
726 aa  319  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
743 aa  318  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.78 
 
 
689 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 
726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
767 aa  309  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 
692 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
724 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
710 aa  303  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
701 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
701 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
723 aa  300  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 
712 aa  300  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 
701 aa  299  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
701 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.75 
 
 
696 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
724 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 
710 aa  296  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
829 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
769 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 
696 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  32.22 
 
 
808 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
701 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
797 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 
713 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.8 
 
 
703 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
701 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
701 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 
757 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.68 
 
 
729 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
703 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 
789 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
722 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
771 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  32.06 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.81 
 
 
806 aa  287  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 
721 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 
817 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  31.11 
 
 
729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  31.11 
 
 
703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  31.11 
 
 
703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.1 
 
 
747 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.31 
 
 
797 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.18 
 
 
752 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  30.86 
 
 
729 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.71 
 
 
703 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 
715 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.65 
 
 
833 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  30.86 
 
 
729 aa  282  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
745 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.56 
 
 
745 aa  281  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  29.97 
 
 
747 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.47 
 
 
747 aa  280  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.47 
 
 
747 aa  280  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
784 aa  279  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 
722 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
733 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 
771 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>