More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2363 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  71.76 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  70.43 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  66.89 
 
 		 306 aa  424  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.42 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.08 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  63.61 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.31 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.87 
 
 		 284 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.87 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.51 
 
 		 286 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.85 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.61 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  51.83 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.83 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.06 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.68 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.42 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.04 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.15 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.84 
 
 		 286 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  50.67 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.86 
 
 		 281 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.39 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.17 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.3 
 
 		 276 aa  265  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  49.34 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.88 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.37 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.59 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.72 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.56 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  34.69 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.62 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  34.16 
 
 		 333 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  33.75 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  34.58 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  34.6 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  39.49 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  33.85 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  33.44 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  33.44 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  33.44 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  36.62 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.34 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.05 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.18 
 
 		 203 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  40.2 
 
 		 203 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.95 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.19 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  35.86 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.2 
 
 		 145 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  52.42 
 
 		 143 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.97 
 
 		 150 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.46 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  49.24 
 
 		 129 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  48.8 
 
 		 149 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.86 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  45.89 
 
 		 144 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.19 
 
 		 127 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.15 
 
 		 128 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.4 
 
 		 142 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  49.6 
 
 		 144 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.8 
 
 		 131 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.46 
 
 		 153 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  50.79 
 
 		 143 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 207 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.54 
 
 		 154 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.24 
 
 		 137 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.2 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.8 
 
 		 137 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.2 
 
 		 138 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  50.4 
 
 		 147 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  49.19 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  47.62 
 
 		 125 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  46.4 
 
 		 133 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  41.98 
 
 		 129 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  46.03 
 
 		 130 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  45.6 
 
 		 132 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  47.2 
 
 		 128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  46.62 
 
 		 127 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  47.2 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.2 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  45.97 
 
 		 123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.35 
 
 		 146 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.8 
 
 		 133 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  44.8 
 
 		 128 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  45.86 
 
 		 127 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  44 
 
 		 138 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  47.2 
 
 		 126 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>