151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2272 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  100 
 
 
711 aa  1442    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.41 
 
 
313 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.04 
 
 
522 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.56 
 
 
831 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.37 
 
 
506 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.6 
 
 
506 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.39 
 
 
346 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  25.56 
 
 
342 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.68 
 
 
668 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 
1079 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.55 
 
 
579 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.32 
 
 
930 aa  88.6  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.36 
 
 
676 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.34 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.09 
 
 
701 aa  84.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.16 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.07 
 
 
1293 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.85 
 
 
1750 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.6 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.19 
 
 
491 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.33 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.19 
 
 
1030 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.06 
 
 
627 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.72 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.13 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.17 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.44 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  24.81 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.28 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  31.05 
 
 
652 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.24 
 
 
1834 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  27.41 
 
 
583 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.89 
 
 
664 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.24 
 
 
469 aa  72  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.69 
 
 
752 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
930 aa  71.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.5 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  24.93 
 
 
1030 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.98 
 
 
365 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 
307 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
772 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.83 
 
 
646 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  21.9 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 
1146 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.78 
 
 
1140 aa  68.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.89 
 
 
709 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.61 
 
 
383 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.45 
 
 
343 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
728 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.74 
 
 
1163 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  26.29 
 
 
487 aa  64.7  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.94 
 
 
368 aa  64.3  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
770 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  26.92 
 
 
355 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.32 
 
 
1051 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  24.79 
 
 
525 aa  63.9  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 
418 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.16 
 
 
588 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.3 
 
 
355 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  28.21 
 
 
694 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.86 
 
 
1292 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
850 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.49 
 
 
693 aa  61.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.7 
 
 
1351 aa  60.8  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 
590 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 
330 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  33.1 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.84 
 
 
903 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  29.34 
 
 
343 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  24.46 
 
 
815 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
892 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  29.2 
 
 
397 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  27.91 
 
 
368 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.54 
 
 
786 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.89 
 
 
343 aa  57.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  28.8 
 
 
397 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  24.41 
 
 
439 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.68 
 
 
372 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.28 
 
 
417 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 
2296 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  28.34 
 
 
380 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  25.96 
 
 
371 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.18 
 
 
1130 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.47 
 
 
1026 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31.55 
 
 
343 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 
1763 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 
1177 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.44 
 
 
447 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 
506 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  27.4 
 
 
398 aa  54.7  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  25.13 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.34 
 
 
623 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  33.55 
 
 
1046 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.29 
 
 
963 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 
354 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 
448 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.570534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>