More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2248 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  100 
 
 
377 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  67.92 
 
 
371 aa  494  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  65.09 
 
 
384 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  68.53 
 
 
376 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  67.11 
 
 
380 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  67.11 
 
 
380 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  63.28 
 
 
390 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  60.05 
 
 
387 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  46.65 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  44.09 
 
 
348 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  43.8 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  46.91 
 
 
364 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  38.21 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  38.21 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  38.21 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  41.5 
 
 
366 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  37.94 
 
 
375 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  37.94 
 
 
375 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  37.94 
 
 
375 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  37.94 
 
 
375 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  37.67 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  37.67 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  37.57 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  37.67 
 
 
375 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  37.67 
 
 
375 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  39.89 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.13 
 
 
360 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  38.3 
 
 
374 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  47.25 
 
 
353 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  38.75 
 
 
374 aa  249  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  37.63 
 
 
371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  37.94 
 
 
372 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.7 
 
 
373 aa  245  9e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  36.86 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.97 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.44 
 
 
386 aa  239  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.86 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  37.9 
 
 
375 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  33.7 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  33.7 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  37.47 
 
 
392 aa  222  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  37.5 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.23 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  33.24 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  45.38 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.96 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.11 
 
 
371 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.68 
 
 
365 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  37.72 
 
 
359 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.71 
 
 
377 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.75 
 
 
364 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  35.5 
 
 
362 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  36.07 
 
 
390 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.04 
 
 
364 aa  206  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  35.52 
 
 
398 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.25 
 
 
371 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.57 
 
 
397 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  33.24 
 
 
365 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  35.77 
 
 
378 aa  202  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  39.3 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.19 
 
 
399 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.09 
 
 
391 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.36 
 
 
380 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  37.46 
 
 
297 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.77 
 
 
363 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.69 
 
 
368 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.42 
 
 
358 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  34.15 
 
 
386 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.24 
 
 
390 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  35.69 
 
 
377 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  36.26 
 
 
376 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  37.4 
 
 
366 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.43 
 
 
370 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.53 
 
 
370 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.65 
 
 
376 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.98 
 
 
401 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  35.24 
 
 
401 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  34.06 
 
 
386 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 
385 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  32.58 
 
 
420 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.78 
 
 
376 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  38.49 
 
 
265 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  33.61 
 
 
380 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  33.8 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  36.76 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.41 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  33.61 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  33.61 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.27 
 
 
359 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  32.84 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.09 
 
 
415 aa  183  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 
381 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  33.59 
 
 
414 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  35.1 
 
 
394 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.15 
 
 
378 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  33.7 
 
 
385 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.78 
 
 
420 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  34.28 
 
 
377 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>